Les principales évolutions dans la connaissance des mycoplasmes des ruminants conséquences en matière de diagnostic et de surveillance

Résumé

Les mycoplasmes sont des bactéries particulières, sans paroi, de tailles cellulaire et génomique réduites. Parmi les 133 espèces de mycoplasmes répertoriées à ce jour, près d’un cinquième sont isolées chez les ruminants qu’elles soient commensales ou pathogènes. Ces dernières sont responsables essentiellement de pneumopathies, mammites et arthrites et quelques autres signes cliniques moins fréquents. Ces dix dernières années, le séquençage des génomes et les analyses de génomiques comparées (entre espèces et entre souches d’une même espèce) ont apporté des connaissances nouvelles en termes de pouvoir pathogène, d’évolution, de transferts de gènes et de mécanismes génétiques responsables de la résistance aux antibiotiques. D’un point de vue pratique, ces connaissances nouvelles ont conduit à : - réviser la taxonomie ; - mettre en évidence la nécessité de revalider régulièrement les techniques diagnostiques qui pourraient être remises en question par l’importante plasticité génomique des mycoplasmes ; - et valider certaines techniques de sous-typage des souches pour la surveillance des maladies et la compréhension de leur histoire évolutive. La diversification des souches par l’expression de divers polysaccharides capsulaires ou extracellulaires apportent une difficulté supplémentaire d’un point de vue diagnostique mais également pour comprendre les interactions avec l’hôte animal. Dans ce contexte, encore très exploratoire, des outils comme le réseau VIGIMYC sont précieux pour constituer des échantillons représentatifs de la diversité et de l’évolution des mycoplasmes.